[갤러리] 심심해서 올리는 작업용 컴짤들

[나루가털기]

청소도 한 겸... 올려봅니다.

제 돈으로 산 것도 있고, 연구실에서 사 준 것도 있습니다.

모든 시스템은 제가 구상해서 사달라고 졸랐습니다. ㅋㅋ.......... 만 램이 모자라서 한 대 더 사달라고 하고 싶은데,

맞아 죽을지도 모르겠네요.

전에도 한번 올렸었던 메인입니다. CPU E5-2690 v3에 램 384G. 이거면 될 줄 알았는데... 요즘 모자라서 골골댑니다.

세컨입니다. CPU, HDD 구성은 다 같은데... 램만 256G입니다. 하는 일은 메인이랑 같습니다. 둘다 콘솔 접속용이라 그래픽카드는 

구린거 그냥 넣었어요.

얘는 제일 처음 구입한 녀석입니다. 이 녀석 덕분에 다른 애들을 연구실에 사달라고 할 수 있었습니다.

CPU는 E5-2650 v2에 램은 128G로 제일 낮지만, (지금은 제일 좋은 놈은 아닌... 당시엔 좋았던) GTX Titan 붙어있습니다. 

CUDA 연산, 잡다구리한 웹어플리케이션 등등도 돌아갑니다. 여기서 테스트해서 괜찮으면 연구실 서버로 옮깁니다.

실질적인 제 리눅스 데탑이죠. 

얘는 윈독 데탑입니다. CPU가 i7 5960x에 램이 32G인가 그렇습니다. 얘는 그냥 일반 작업합니다.

오피스, 웹 접속, 콘솔 접속 등등... 집에 CPU가 i7 5820k도 한 대 있는데, 리눅스 깔아서 집에서 작업할 때 씁니다.

솔직히 5960x쪽은 3.9G인가 오버했는데, 5820k와 무슨 차이가 나는지 잘 모르겠습니다. CPU 풀로드 돌면 차이가 좀 나는 것 같긴한데...

풀로드 작업들은 메인, 세컨 웍스로 작업하다보니, 얘들은 가벼운 일들만 합니다. 

청소가 끝났으니 한번 모아봅니다...

제일 오른쪽 nas는 3T짜리 4개 묶은 건데... 솔직히 구입한거 후회합니다.

차라리 파일서버 컴을 짜서 3T 한 6개 묶고, 백업도 할 수 있게 해놓을걸 싶어요.

돈도 비슷하게 들었을텐데.... 싶습니다. 다른 사람들도 접근하기 편하게 해주려고 저걸 샀는데...

저만 씁니다. 젠장 ㅋㅋㅋ....

하는 일은 유전자 분석쪽입니다. Whole genome assembly라던가 RNASeq이라던가 합니다. marine copepod 같은 non-model organism들이다보니

사양을 많이 안타고 작업할 수 있습니다. 이쪽 일 많이 하시는 분들은 잘 아실텐데... 1T, 2T 시스템들은 허다합니다.

이 시스템들은 소소한 정도죠. 여튼 이만 줄입니다~ 나중에 새 시스템 구입하면 또 올리겠습니다. ㅎㅎ

[V=IR]

ㅎㄷㄷㄷㄷㄷㄷㄷ 잘 보고 갑니다

[화이트프린스]

역시 암만, 개인 사용자들이 올려봐야 전문적으로 사용하는 컴퓨터는 못 따라간다..

[도박하면손가락]

아놔... 램을 ssd용량으로 착각 ㅋㅋㅋ

[kelso]

지렸습니다

[Ruell]

저런걸로 랜더링 돌리고 싶네요 ㅠㅠ

[오그레이트]

램 용량이 우리집 SSD보다 더 크네요 ㄷㄷㄷ

[프리미어득점왕]

램슬롯이 저렇게 많은보드 처음보네

[루리웹-440135129]

배정밀도연산에 좋은 타이탄(타이탄 블랙)이네요 +_+
메인컴은 테슬라 인가요?

[나루가털기]

메인컴은 CPU 연산만 하고 있습니다. PCI 슬롯에 달린 것은 인텔 750 ssd에요.

[날으는 곰담]

저도 유전체 분석을 하는데 Whole genome assembly하실때 de novo assembly하시는건가요? 휴먼이나 마우스 같은 경우 분석하기엔 과도한 스펙이신거 같아서 아님 샘플수가 많으셔서 그걸 동시에 여러 터미널로 돌리시는건지.... 같은 업종이라 궁금하네요

[나루가털기]

네. 위에서도 밝혔듯 non-model organism의 whole genome assembly 작업을 하고 있습니다. 그 외에도 Gene prediction & annotation 작업도 하고 있구요. non-model organism이다보니 당연히 de novo로 진행하고 있구요. 한대 당 하나의 작업 밖에 못한다고 보시면 됩니다. de novo assembly는 지금 사양으로 Allpaths-LG의 경우, 300-400 mb 이상의 작업은 할 수 없습니다. 250 mb까지는 원활하게 되더군요. de novo에서는 384G 정도는 낮은 사양이지요. Allpaths-LG로 작업하면 500 mb 이상은 램 1T 정도는 필요합니다. 이번에 약 genome size 700 mb의 작업을 하고 있는데 꽤 애를 먹고 있습니다. Reference가 충분한 human이나 mouse의 경우에는 whole genome이 아닌 일부 genome을 분석하는 경우가 더 많다고 알고 있습니다. 그러면 당연히 사양은 낮아도 문제가 없습니다. RNASeq은 훨씬 더 낮은 사양에서도 작업이 가능합니다. 전체 서열의 Blast나 Interpro 정도가 문제일텐데요... 이것도 i7 4790k 3-4대 묶은 HPC cluster면 2-3일 내에 끝낼 수 있구요.
식물 쪽으로 넘어가면 얘들은 genome size가 1G, 2G인 경우도 허다해서 램이 2T 급 이상도 필요하고... 아주 골때린다고 하더군요. 그래서 HPC 안쓰고 Single workstation으로는 못버티는 경우도 많고, MPI 지원하는 assembler를 modify해서 쓰는 경우도 많다 들었습니다.
리플을 쓰고보니 너무 허접해서 좀 수정했습니다. 동종업계시라니 반갑네요. ^^

[쩡이많은]

사양보고 프로게이머신줄..